Дневник будущего: Повторный набор

События аниме разворачиваются спустя некоторое время после финала оригинального сериала. По мере развития сюжета мы снова сталкиваемся со всеми главными носителями дневников — хранителями, судьбы которых переплетены с загадочным Deus Ex Machina, и сейчас понятно, что у вершителя решения осталось очень мало времени на выбор нового бога. Юно Гасай из третьего мира неожиданно начинает видеть воспоминания Юно из первого мира. Она живёт с ощущением, что утратила нечто крайне ценное, но не может понять, что именно. Это тревожит молодую девушку и заставляет сомневаться в собственной памяти. Что произойдет, если память вернется? Откроется ли дорога к началу новой игры, к концу или же всё может закончиться всё ещё хеппи-эндом?