Завязкой аниме «Детективное агентство Дятел» становится загадочный инцидент из мира потустороннего: на двенадцатом этаже старого здания в районе Асакуса Дзюникай появляется призрак. Это событие настолько необычно, что о нем вышла отдельная газетная заметка, привлекая внимание широкой публики. Возникает вопрос: означает ли появление духов нечто действительно доказуемое, или речь идёт лишь о ловкой мистификации? Разобраться в этом хотят Такубоку Исикава, хозяин частного детективного бюро, и его преданный помощник Кёсукэ Киндаити. Их расследование соединяет холодный анализ фактов и живую интуицию, заставляя сомневаться в очевидном и перепроверять каждую версию. Постепенно на фоне загадочного призрака разворачиваются отношения между героями, а вместе с ними — тайны города, мотивы преступников и грань между реальностью и сверхъестественным, которую им предстоит перейти, чтобы узнать правду и, возможно, очистить имя невинных.
