К 2010 году гигантские гиперураганы охватили всю атмосферу планеты, нанося колоссальные повреждения всем странам. Население Земли, достигающее восьми миллиардов, в одно мгновение потеряло около пяти миллиардов жизней. Северная Америка оказалась во льду, Россия — в ледяной мгле, северная Европа затонула под водой, и карта мира изменилась до неузнаваемости, погружая человечество в эпоху хаоса. Японское правительство сумело создать автономное экономическое государство, частично оправившись после катастрофы. Значительную роль в восстановлении экономики сыграла технология Дополнительной Силы, долгое время находившаяся в разработке. Но за пределами Особой Экономической Зоны царила нищета. Правящий класс провозгласил себя Логосом и применял ТДС в военных целях. Малоимущие, прозванные «ревенусами», были изгнаны за пределы ОЭЗ. Для контроля над военной мощью Японии Европейский Союз ЭО и Азиатский Союз АО учредили Единый союз АЭС; их войска соединились в Кюсю и встретили натиск передовой силы «Фантом». После этого был подписан двусторонний договор о ненападении с АЭС, и военные силы стали использоваться против повстанцев внутри страны. С тех пор прошло время. Джо Кацураги и Джин Цурасава уклоняются от фантомов, созданных для наблюдения за ревенусами и подавления мятежных элементов Логоса. Вместе с ними в бегство отправляется таинственная девочка Сана Нобуто. И почему-то множество людей заинтересовано в ней — у каждого своя причина.
