Действие перенесено в 1924 год и в альтернативную Европу, в княжество Совилл, укрытое Альпами от чужих глаз. Здесь учится Кадзуя Кудё, японец по обмену и младший сын военной династии, который учащается в престижной Академии Святой Маргариты. В стенах учебного заведения витает поток легенд и тревожных историй, многие из которых Кадзуя воспринимает как шумную мистификацию, но история о таинственном корабле-призраке под названием «Королева Бэрри» не даёт ему покоя. Его близкую подругу Викторику де Блуа больше привлекают сами факты и логика: благодаря исключительному уму она распутывает загадки, с которыми не справляются даже знаменитые сыщики. По стечению обстоятельств любознательность Викторики втягивает двоих школьников на борт судна, которое точно соответствует легенде о «Королеве Бэрри» — корабле, чьё существование может оказаться ключом к разгадке зловещей тайны, скрывающейся за пределами обыденной реальности.
