История аниме H2O: Следы на песке вращается вокруг Такумы Хиросе, школьника, который по неизвестной причине лишился зрения. Чтобы поправить своё здоровье, юноша отправляется жить в сельскую местность вместе с дядей. Там он встречает нескольких девушек, и три из них резко выделяются на фоне остальных: Хаями Кохината, Хината Кагура и Отоха. Именно Отоха на время возвращает Такуме утраченное зрение, и, снова увидев мир, он начинает помогать Хаями — той, против чьего отношения к нему, по непонятной причине, жители деревни питают враждебность. Между тем в маленьком сообществе начинают раскрываться тревожные секреты, скрытые под слоями молчания и обыденности. По мере того как Такума исследует новые связи и встречает преграды, его взгляд на дружбу, доверие и ответственность меняется. Тайны прошлого и боль настоящего переплетаются с надеждой на исцеление, заставляя героя переосмыслить понятия света и темноты в жизни людей вокруг.
