Человечество пережило долгий кризис после вторжения инопланетян, известных как Бета, которое началось еще в 1973 году и перевернуло привычное существование людей. Тогда на фронтах повсеместно распространились гигантские боевые экзоскелеты — ТНИ — призванные держать оборону и сдерживать натиск врага. Но даже они не смогли полностью искоренить угрозу: Бета продолжали давить на цивилизацию, и в разгар конфликта огромные территории Евразии стали непригодны для жизни. Война затянулась на три десятилетия, и человечество пришло к выводу, что победа невозможна — остаётся лишь изнуряющая борьба сил. В 2001 году в Японской Империи начинается создание нового поколения ТНИ, которую планируют задействовать для защиты дальневосточных линий фронта. США включаются в программу и вместе с Японией продвигают проект под кодовым названием «Протуберанец». Юи Такамура, пилот ТНИ Имперской Королевской Стражи Японии и руководитель этого начинания, направляется на Аляску, чтобы запустить первые испытания. В то же время американский пилот Юя Бриджес отправляется туда же ради той же миссии. Их встреча становится судьбоносной: она навсегда изменит ход истории всего человечества.
